Налоговые льготы для резидентов Сколково

Набор преференций для участников проекта «Сколково» прописан в Налоговом кодексе. По налогу на прибыль — статья 246.1: компания вправе не исполнять обязанности налогоплательщика в течение 10 лет с момента получения статуса. По НДС — статья 145.1: освобождение от налога на реализацию, тоже на 10 лет. По налогу на имущество льгота для участников «Сколково» предусмотрена пунктом 20 статьи 381 НК. Для её подтверждения представляют документы о статусе участника и данные учёта доходов и расходов.

Отдельно стоит льгота по страховым взносам. Резидент платит с части выплаты работнику в пределах 1,5 МРОТ за месяц 30 % до достижения единой предельной базы и 15,1 % сверх неё; с части выплаты свыше 1,5 МРОТ — 15 %. Это не освобождение, а пониженный тариф, и он действует, пока компания в реестре.

На упрощённой системе налога на прибыль нет — там налог по УСН. Освобождать по статье 246.1 нечего, и налог по УСН резидент платит полностью. Обнуляется только НДС: освобождение по статье 145.1 распространяется и на упрощенцев.

Поэтому общая система часто выгоднее: на ОСНО снимаются и налог на прибыль, и НДС. Но выбор зависит от покупателей. Если основные клиенты — компании на общей системе, которые заявляют вычет по НДС, освобождение может ухудшить вашу позицию: клиент не получит счёт-фактуру и может потребовать скидку. Если покупатели — физлица или компании на УСН без НДС, освобождение обычно в плюс.

С 1 января 2026 года резидент Сколково не может применять пониженные тарифы страховых взносов, предусмотренные для ИТ-компаний, даже при наличии ИТ-аккредитации. Это правило ввёл закон № 425-ФЗ от 28 ноября 2025 года. Совмещать две льготы по взносам больше нельзя: придётся выбрать Сколково или ИТ-аккредитацию.

Похожий запрет действует и по налогу на прибыль: резидент не может одновременно пользоваться освобождением по статье 246.1 и ставкой 5 % для ИТ-компаний по пункту 1.15 статьи 284 НК. Если компания утратила право на освобождение, перейти на ИТ-ставку можно только отказавшись от статуса резидента Сколково.

Ещё одно ограничение: если в уставном капитале есть прямое или косвенное участие иностранных агентов с долей от 10 %, компания лишается права на пониженные ставки — это касается в том числе резидентов Сколково.

Освобождение по НДС и налогу на прибыль не автоматическое: каждый год нужно подтверждать право. Начав применять освобождение по НДС или налогу на прибыль, резидент направляет уведомление и подтверждающие документы не позднее 20-го числа следующего месяца. Затем право подтверждают в сроки, установленные статьями 145.1 и 246.1 НК для каждого налога. Если этого не сделать, льгота может быть утрачена.

С 2026 года ужесточились правила проекта: не меньше 70 % доходов компания должна получать от своих разработок, доля иных доходов — не больше 30 %, и эти доходы нельзя направлять на дивиденды. В ЕГРЮЛ должен быть указан код ОКВЭД 72 «Научные исследования и разработки» или его подклассы. За несданный вовремя годовой отчёт — исключение из проекта и потеря всех льгот.