Субсидия и НДС: облагается ли субсидия, вычет и восстановление налога

Налоговая база по НДС растёт на суммы, связанные с оплатой реализованных товаров, работ и услуг (подпункт 2 пункта 1 статьи 162 НК РФ). Деньги, которые с оплатой не связаны, в базу не входят. Поэтому первое, что смотрят по любой субсидии, — на что она выдана: на покупки для бизнеса или на выпадающую выручку.

Субсидия на возмещение затрат по приобретению товаров, работ, услуг в базу по НДС не включается: она не связана с оплатой того, что налогоплательщик продаёт. Так же не включается субсидия, которая компенсирует потери от применения государственных регулируемых цен и льгот отдельным потребителям, — это прямо записано в пункте 2 статьи 154 НК РФ.

Субсидия на возмещение недополученных доходов от обычных продаж — это по сути доплата за уже отгруженный товар или оказанную услугу. Её включают в базу и начисляют НДС. Если в документах на субсидию сумма указана с налогом, налог считают по расчётной ставке — как с суммы, связанной с оплатой реализации.

Отдельно стоит возмещение выпадающих доходов, которое не связано с регулируемыми ценами и льготами: его рассматривают как плату за реализацию, и НДС с него начисляют.

Пункт 2.1 статьи 170 НК РФ ограничивает вычет по покупкам, оплаченным за счёт бюджетной субсидии, в доле финансирования затрат с НДС. Если документы предусматривают финансирование затрат без НДС, ограничение не применяется. Логика простая: бюджет уже оплатил товар вместе с налогом, второй раз возвращать его из бюджета через вычет нельзя.

Иное дело — субсидия на недополученные доходы. Она не оплачивает ваши закупки, поэтому право на вычет входного НДС по обычным затратам она не отменяет и восстанавливать налог не требует.

Восстановление привязано к субсидиям на возмещение затрат: если налог по приобретённым товарам, работам, услугам уже принят к вычету, а потом пришла субсидия из федерального бюджета на возмещение этих затрат, налог восстанавливают в том периоде, когда получены деньги (подпункт 6 пункта 3 статьи 170 НК РФ). Правило распространяется на субсидии из бюджетов бюджетной системы РФ, в том числе регионального. При получении субсидии на возмещение затрат проверяют условия финансирования и сумму налога, подлежащую восстановлению.

Федеральный закон от 25.05.2026 № 143-ФЗ поправил Бюджетный кодекс: когда получатель субсидии передаёт эти деньги другим лицам на безвозмездной и безвозвратной основе, в соглашении с ними нужно прямо указать, что источник средств — субсидия, и прописать, включены ли в передаваемую сумму НДС. Уже заключённые соглашения приводят в соответствие.

Смысл поправки — не дать вернуть из бюджета налог, который бюджет и оплатил. Если деньги пришли из казны, а получатель передал их дальше, документы должны показывать, есть ли в сумме НДС: от этого зависит, вправе ли конечный получатель заявлять вычет.

Закон вступил в силу 5 июня 2026 года, отдельные положения действуют с 1 сентября 2026 года. Практический шаг для получателя субсидии — проверить действующие соглашения о передаче средств и дописать в них источник финансирования и условие про НДС.